Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TCOF1Q13428 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TCOF1Q13428 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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