Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SRSF5Q13243 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SRSF5Q13243 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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