Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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PRKAA1Q13131 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRKAA1Q13131 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRKAA1Q13131 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRKAA1Q13131 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRKAA1Q13131 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRKAA1Q13131 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PRKAA1Q13131 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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PRKAA1Q13131 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PRKAA1Q13131 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PRKAA1Q13131 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PRKAA1Q13131 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PRKAA1Q13131 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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PRKAA1Q13131 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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