Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXC1Q12948 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXC1Q12948 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXC1Q12948 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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FOXC1Q12948 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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FOXC1Q12948 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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FOXC1Q12948 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
FOXC1Q12948 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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