Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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CNTN1Q12860 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CNTN1Q12860 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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