Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SREBF2Q12772 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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