Protein–RNA interactions for Protein: Q03052

POU3F1, POU domain, class 3, transcription factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F1Q03052 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
POU3F1Q03052 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms