Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TFAMQ00059 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TFAMQ00059 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms