Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3AP84243 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3AP84243 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3AP84243 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3AP84243 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
H3F3AP84243 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H3F3AP84243 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H3F3AP84243 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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