Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPCAP84074 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPCAP84074 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HPCAP84074 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HPCAP84074 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms