Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CLDN10P78369 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CLDN10P78369 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms