Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ACTA1P68133 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ACTA1P68133 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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