Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMSP52788 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMSP52788 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMSP52788 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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