Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLCSP50747 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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HLCSP50747 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLCSP50747 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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