Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TTPAP49638 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TTPAP49638 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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