Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK8P49336 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK8P49336 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDK8P49336 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms