Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ETFBP38117 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ETFBP38117 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ETFBP38117 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms