Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GPC1P35052 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms