Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ECHS1P30084 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms