Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPHA3P29320 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms