Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GTF2E1P29083 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms