Protein–RNA interactions for Protein: P28907

CD38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD38P28907 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CD38P28907 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CD38P28907 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD38P28907 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD38P28907 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD38P28907 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD38P28907 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD38P28907 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD38P28907 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CD38P28907 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CD38P28907 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms