Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GCAP28676 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GCAP28676 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GCAP28676 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GCAP28676 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCAP28676 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms