Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SSFA2P28290 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms