Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTGS1P23219 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms