Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
POLR2CP19387 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
POLR2CP19387 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
POLR2CP19387 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms