Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BRAFP15056 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BRAFP15056 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BRAFP15056 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BRAFP15056 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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BRAFP15056 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BRAFP15056 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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