Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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PRG2P13727 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PRG2P13727 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PRG2P13727 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PRG2P13727 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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