Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CDH1P12830 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CDH1P12830 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CDH1P12830 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms