Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
DMDP11532 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
DMDP11532 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DMDP11532 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms