Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TMIGD3P0DMS9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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