Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CENPBP07199 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CENPBP07199 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPBP07199 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPBP07199 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPBP07199 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CENPBP07199 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CENPBP07199 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CENPBP07199 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBP07199 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CENPBP07199 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms