Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIN3BO75182 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms