Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PPFIA3O75145 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms