Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NDUFS4O43181 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
NDUFS4O43181 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms