Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLGNO14967 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLGNO14967 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms