Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BCKDKO14874 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms