Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GOLGA8SH3BPF8 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms