Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HACD1B0YJ81 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms