Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC107463.1-201ENST00000508605 667 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
XIRP2A4UGR9 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
XIRP2A4UGR9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms