Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CCDC162PA2VCL2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CCDC162PA2VCL2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms