Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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C9orf170A2RU37 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf170A2RU37 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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