Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PLXND1Q9Y4D7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PLXND1Q9Y4D7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms