Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAPPC8Q9Y2L5 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms