Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DSEQ9UL01 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms