Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXD3Q9UJU5 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXD3Q9UJU5 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXD3Q9UJU5 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXD3Q9UJU5 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXD3Q9UJU5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXD3Q9UJU5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXD3Q9UJU5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXD3Q9UJU5 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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