Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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VAPAQ9P0L0 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
VAPAQ9P0L0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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