Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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KCMF1Q9P0J7 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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