Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKIRAS1Q9NYS0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms