Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXK8

FBXL12, F-box/LRR-repeat protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL12Q9NXK8 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FBXL12Q9NXK8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms